جنین در داخل تخم نطفه دار یک موجود زنده است و تنفس می کند. بنابراین باید تهویه هوای مناسب در مکان استفاده از دستگاه جوجه کشی وجود داشته باشد تا اکسیژن وارد محیط شده و دی اکسیدکربن از آن دفع گردد. ورود و خروج اکسیژن و دی اکسید کربن به تخم نطفه دار از طریق منافذ موجود بر روی پوسته انجام می گیرد